A ESCE/IPS desenvolve as suas atividades através de diversas unidades organizacionais, atuando nos domínios do ensino, da investigação e da prestação de serviços, de modo coordenado entre si. Tendo em conta os objetivos que prosseguem e as funções que desempenham, as unidades organizacionais da ESCE/IPS classificam-se em Órgãos da Escola e Serviços de Apoio.
> Órgãos da Escola
Fazem parte dos Órgãos da Escola:
- Conselho de Representantes
- Diretor
- Conselho Técnico-Científico
- Conselho Pedagógico
- Conselho de Coordenação
- Conselho Consultivo
- Departamentos
> Serviços de Apoio
Os Serviços de Apoio são serviços que possibilitam o bom funcionamento da Escola, nomeadamente:
- Apoio Pedagógico e Economato 2
- Serviço de Imagem e Comunicação
- Serviço de Apoio ao Estudante
- Bibliotecas IPS
- Manutenção e Limpeza
- Divisão Académica
- Divisão Informática